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オリジナルソフトウェア

 *ここでは当研究室で開発したソフトウェア/ツール類を公開しています.

開発ソフト

SAXS解析プログラム(Small Angle X-ray Group)>>

*SAXSの基礎理論はこちら

Guinier Analysis Program(Webアプリケーション版):小角側データ解析用

Porod/Luzzati Analysis Program(Webアプリケーション版):広角側データ解析用

*Webアプリケーション版の逆行列の計算では、Jacobi法(固有値解法)の代わりに掃き出し法を用いています

アクセント予測システム(Accent_Sandhi_by_EAUT)>>

*日本語複合語のアクセント句を予測します(詳細はこちら

*sandhiとは連声れんじょうを指し、元来サンスクリット(梵語)の文法において文や語が連結する際に発音が変化する規則のこと。日本語の連声は個別的なので、CRF(条件付き確率場)を用いて予測します。

便利ツール

緩衝液作成支援ツール>>

*緩衝液の種類、pH、濃度、全量を指定すると、必要な試薬量が計算されます

タンパク質の分子量・等電点・吸光度の計算>>

*アミノ酸配列を入力すると、分子量、1mg/mLの吸光度、等電点が計算されます

タンパク質の二次構造の予測>>

*アミノ酸配列から、タンパク質の二次構造を予測します

タンパク質の変性曲線の解析(UnfoldingFit)>>

*タンパク質の変性曲線を二状態転移に基づいて解析します(平衡論解析のみ)

*非線形最小二乗法はdownhill simplex法で、逆行列の計算は掃き出し法で行っています